1月10日 本会启动了在全市科普教育基地举办《科普讲解词征文大赛》活动的序幕，活动详细规定了比赛的具体要求、截止征文截止时间及奖励的方法。
1月26日 本会组织了中国乳业博物馆、上海动物园、光明酸奶科技展示馆、野生动物园等基地,联合协助上海科技馆策划“牛年生肖特色展”。会上，“科普工作者与观众面对面”的活动，深受观众的喜爱，仅春节七天接待参观者达数十万人次，各类新闻媒体都相继报道，取得丰硕的成果。
2月4日 本会与上海市血液中心共同发起的“爱心连你我，共谱和谐情”的科普爱心活动，在上海科技馆举行了启动仪式，儿童博物馆、东方绿舟和上海市农业科学院等40家科普教育基地参与了此项活动。
2月11日 根据市科普工作联席会议办公室的文件精神，本会在上海体学院举办年检“网上填报”培训班。正式启用了上海市科普教育基地数据库及管理系统，全市187家科普基地有173家参加了网上检查填报及审核工作。向市科委提交《2008年度上海市科普教育基地基本情况报告》一份。
2月24日 2008年度上海市科普教育基地联合会年会假座上海儿童博物馆召开，来自全市140家科普教育基地的150名代表参加了会议。年会积极响应政府倡导的“抱团取暖”的理念，采用圆桌茶话会+互动游戏+助兴抽奖的形式，并在宽松的气氛下完成了联合会的总结、财务报告、推优颁奖等既定程序，达到了传递信息、激励先进、互通经验的目的。
3月3日 在青浦博物馆召开了通讯员会议，有近20家单位参加了会议。会后，参观了青浦博物馆、上海匾额博物馆。
3月20日 本会协助市科委，市旅委在公安博物馆联合举办了“科普旅游推进会”并制作流动展版，宣传策划了各主题科普旅游专线的建议方案。
4月18日 中国自然科学博物馆协会理事长，原中国科协副主席徐善衍由联合会施新泉、张建卫、李军等陪同，考察了上海中医药博物馆、上海集成电路科技馆，上海风电科普馆及上海鲜花港等科普教育基地。
4月20日 2009年收到新基地申报材料37份，联合会会同上海科学普及促进中心，在各区县科委（协）的支持和帮助下，按照《市科普教育基地标准》，对37家申报单位进行了调研初审，向市科委提交的《2009年新基地申报的工作报告》。
5月15日 全国科技节上“上海纺织博物馆”等33家单位被上海市科普工作联席会议办公室命名为《上海市科普教育基》。上海的科普教育基地建设已发展到218家。
5月16日 本会协助市科委组织了上海29家市级科普教育基地积极参与了全国科技节期间，上海“科技、人、城市——与世博同行”主题互动展览，还拍摄了近40幅上海科普教育基地的精彩作品，参与了“迎世博——让科技进入城市生活”摄影作品展。
6月18日 本会在上海纺织博物馆召开了2009年度新命名科普教育基地负责人会议。会后，参观了上海纺织博物馆、苏州河梦清园环抱主题公园。
7月 8日 2009年度科普讲解员（初级）培训班开班仪式假上海隧道科技馆举行,共有46家单位科普基地的76名科普讲解员参加了培训，这是本会举办讲解员培训班以来参加人数最多的一次。
7月 8日 本会组织科普基地人员赴台湾宝岛进行了为期8天科普考察，有21家基地的30位科普工作者，通过考察学习，开阔眼界，提高了科普人员的场馆能力建设。
7月21日 本会承担的《上海市科普教育基地数据库及管理系统》一期项目，通过市科委组织的专家组验收。该项目在上海科普促进中心的共同参与下，得到了全市科普教育基地的大力支持与配合，基本完成了该项目的信息资料收集、整理、数据库及管理系统的建立。08、09年的年度基地检查与申报均使用了该管理系统。
8月12日 本会在儿童博物馆组织了科普基地摄影爱好者的摄影讲座。少儿出版社的张峻松副秘书长系统地讲述了照相机的原理及摄影技术巧，使摄影爱好者得益非浅。
8月28日 本会在上海纺织博物馆召开有关专家征文比赛的评审会议。这次征文比赛共有37家科普基地参与，收到比赛稿件84篇。经过专家们认真的审阅、评比，评选了一、二、三等奖和优胜奖、组织奖。
9月18日 9月18日在沪杏科技图书馆召开了第三届第六次常务理事会，会议审议通过了《2009年上半年度的工作报告》、《联合会会议制度》、《联合会财务报销管理制度》报告，以及《联合会评选表彰操作细则》草案。初步形成了社会团体内部的管理机制，营造了良好的和谐发展环境。
9月26日 本会假儿童博物馆召开了《上海科普教育》杂志通讯员会议，有80余家科普教育基地通讯员参加了会议。杂志编辑部郑瑛、张峻松两位副秘书长分别就今年杂志组稿和投稿情况，稿件使用等情况进行了汇报和交流，并进一步解释了杂志投稿以及对图片的要求，加强了编辑与基地通讯员的沟通、联系。
10月 配合市科委组织了上海科技馆、纺织博物馆、隧道科技馆、银行博物馆、禁毒科普教育馆、儿童博物馆、城市规划展示馆、上海动物园、院士风采馆、海军医学研究所等科普教育基地的十几位科普讲解员参与上海工业博览馆的展示接待工作，体现科普基地科普工作者的风采。
11月11日 本会组织参与“十一五”教师培训的近三十名负责人和讲课老师赴江苏淮安的《淮扬菜文化博物馆》和扬州的《双博馆》参观学习及各基地进行工作经验交流。
11月17日 本会假上海铁路博物馆召开了2009年度讲解词征文比赛颁奖大会，会上向获奖者颁发了奖章，并专家对获奖作品作了讲评。
12月10日 本会假苏州河梦清园环抱主题公园召开了“十一五教师培训” 观摩教学和工作总结会。《社会科技教育资源整合利用的理论和实践》课程的教学任务，历经三年的时间，完成了南汇等19个区，接待科技教师6000多人次培训工作，各区县参加培训的教师普遍反映较好，持续三年的“十一五教师培训”任务圆满地划上了句号。
12月17日 本会的科普场馆行业委员会在隧道科技馆召开了《世博年与科普场馆》专题座谈会，有十几家专题性场馆和科普促进中心等20位同行出席会议，与会者紧扣主题畅所欲言。会议充分肯定了科普场馆的硬件能力建设已成为本市科普事业建设中的一道亮丽的风景线，但科普场馆的软件能力建设还有待于提高与加强。
12月27日 本会首次组织了上海慈善机构的近30名智障人及部分陪同人员，共计49名同志参观了长风海洋科普基地，活动得到了上海灰狐文化传播有限公司及长风海洋科普基地的支持与赞助。